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2001年廣納人才招募各方專業人士加盟，成立「大樹連鎖藥局」。2002年成功導入線上即時分析系統(ERP) ，讓藥局所有管理符合人性化、效率化、穩定性、安全性及即時性。2006年導入處方調劑系統，使處方調劑之硬體水準達醫學中心之等級。進駐全台第一座以群聚醫療及結合美式商圈概念之【醫茂首創館】，成為兼具健康、專業與商業之複合型社區藥局。2007年發行自有健康刊物「大樹健康誌」。協助「大仁藥理科技大學」於校內成立實習藥局。2009年「大樹連鎖藥局」與台灣前五大藥廠「信東生技股份有限公司」合作，共同承接世界第二大通路、台灣第一大賣場「家樂福」之賣場內健康營養部，並以大樹藥局與家樂福之共同商標設立藥局。2013年公司創新設立「南平-群聚式醫療園區」，提供社區民眾「基層醫療自付額」，醫院等級「多科別便利性就醫」。2014年登錄興櫃。更名為大樹醫藥股份有限公司。2015 年9 月起正式與阿里巴巴集團旗下之天貓國際合作展開跨境電商銷售平台。